Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD28P10747 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD28P10747 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD28P10747 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD28P10747 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD28P10747 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD28P10747 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD28P10747 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD28P10747 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD28P10747 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD28P10747 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD28P10747 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD28P10747 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD28P10747 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD28P10747 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD28P10747 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD28P10747 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD28P10747 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD28P10747 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD28P10747 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD28P10747 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD28P10747 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CD28P10747 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD28P10747 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD28P10747 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD28P10747 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD28P10747 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD28P10747 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD28P10747 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD28P10747 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD28P10747 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD28P10747 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD28P10747 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD28P10747 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD28P10747 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD28P10747 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD28P10747 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD28P10747 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD28P10747 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD28P10747 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD28P10747 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD28P10747 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD28P10747 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD28P10747 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD28P10747 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD28P10747 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD28P10747 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD28P10747 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD28P10747 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD28P10747 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD28P10747 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD28P10747 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD28P10747 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD28P10747 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD28P10747 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD28P10747 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD28P10747 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD28P10747 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD28P10747 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD28P10747 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD28P10747 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD28P10747 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD28P10747 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD28P10747 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD28P10747 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD28P10747 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD28P10747 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD28P10747 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD28P10747 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD28P10747 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD28P10747 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD28P10747 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD28P10747 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD28P10747 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD28P10747 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD28P10747 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD28P10747 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD28P10747 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD28P10747 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD28P10747 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CD28P10747 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD28P10747 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD28P10747 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD28P10747 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD28P10747 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD28P10747 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD28P10747 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD28P10747 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD28P10747 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD28P10747 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD28P10747 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD28P10747 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD28P10747 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD28P10747 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD28P10747 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD28P10747 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD28P10747 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD28P10747 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD28P10747 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD28P10747 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms