Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC166P0CW27 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms