Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms