Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00032P0C843 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms