Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
POLA1P09884 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
POLA1P09884 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
POLA1P09884 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
POLA1P09884 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
POLA1P09884 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
POLA1P09884 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
POLA1P09884 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
POLA1P09884 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
POLA1P09884 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
POLA1P09884 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
POLA1P09884 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
POLA1P09884 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
POLA1P09884 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
POLA1P09884 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
POLA1P09884 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
POLA1P09884 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
POLA1P09884 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
POLA1P09884 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
POLA1P09884 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
POLA1P09884 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
POLA1P09884 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
POLA1P09884 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
POLA1P09884 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
POLA1P09884 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
POLA1P09884 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
POLA1P09884 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
POLA1P09884 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
POLA1P09884 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
POLA1P09884 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
POLA1P09884 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
POLA1P09884 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
POLA1P09884 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
POLA1P09884 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
POLA1P09884 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
POLA1P09884 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
POLA1P09884 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
POLA1P09884 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
POLA1P09884 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
POLA1P09884 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
POLA1P09884 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
POLA1P09884 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
POLA1P09884 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
POLA1P09884 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
POLA1P09884 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
POLA1P09884 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
POLA1P09884 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
POLA1P09884 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
POLA1P09884 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
POLA1P09884 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
POLA1P09884 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
POLA1P09884 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
POLA1P09884 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
POLA1P09884 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
POLA1P09884 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
POLA1P09884 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
POLA1P09884 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
POLA1P09884 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
POLA1P09884 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
POLA1P09884 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
POLA1P09884 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
POLA1P09884 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
POLA1P09884 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
POLA1P09884 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
POLA1P09884 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
POLA1P09884 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
POLA1P09884 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
POLA1P09884 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
POLA1P09884 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
POLA1P09884 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
POLA1P09884 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
POLA1P09884 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
POLA1P09884 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
POLA1P09884 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
POLA1P09884 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
POLA1P09884 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
POLA1P09884 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
POLA1P09884 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
POLA1P09884 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
POLA1P09884 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
POLA1P09884 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
POLA1P09884 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
POLA1P09884 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
POLA1P09884 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
POLA1P09884 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
POLA1P09884 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
POLA1P09884 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
POLA1P09884 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
POLA1P09884 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
POLA1P09884 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
POLA1P09884 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
POLA1P09884 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
POLA1P09884 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
POLA1P09884 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
POLA1P09884 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
POLA1P09884 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
POLA1P09884 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
POLA1P09884 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
POLA1P09884 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
POLA1P09884 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms