Protein–RNA interactions for Protein: P06732

CKM, Creatine kinase M-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMP06732 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKMP06732 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKMP06732 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKMP06732 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKMP06732 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKMP06732 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKMP06732 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKMP06732 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKMP06732 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKMP06732 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKMP06732 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKMP06732 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKMP06732 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKMP06732 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKMP06732 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CKMP06732 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKMP06732 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKMP06732 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKMP06732 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKMP06732 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKMP06732 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKMP06732 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKMP06732 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKMP06732 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKMP06732 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKMP06732 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKMP06732 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKMP06732 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKMP06732 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKMP06732 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKMP06732 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKMP06732 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMP06732 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMP06732 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMP06732 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMP06732 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMP06732 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMP06732 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMP06732 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMP06732 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMP06732 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMP06732 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMP06732 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMP06732 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMP06732 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKMP06732 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKMP06732 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKMP06732 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKMP06732 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKMP06732 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CKMP06732 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKMP06732 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CKMP06732 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CKMP06732 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CKMP06732 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKMP06732 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKMP06732 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKMP06732 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKMP06732 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKMP06732 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKMP06732 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKMP06732 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKMP06732 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKMP06732 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKMP06732 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKMP06732 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKMP06732 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKMP06732 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKMP06732 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKMP06732 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKMP06732 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKMP06732 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKMP06732 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKMP06732 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKMP06732 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKMP06732 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKMP06732 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKMP06732 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMP06732 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMP06732 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMP06732 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMP06732 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMP06732 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMP06732 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMP06732 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMP06732 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMP06732 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMP06732 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMP06732 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMP06732 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMP06732 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMP06732 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMP06732 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMP06732 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMP06732 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMP06732 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMP06732 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMP06732 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMP06732 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMP06732 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms