Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL2A1P02458 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL2A1P02458 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL2A1P02458 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms