Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	BCS1	YDR375C	1371 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	SPT10	YJL127C	1923 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	COP1	YDL145C	3606 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	CDH1	YGL003C	1701 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	TED1	YIL039W	1422 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	MIX14	YDR031W	366 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	LIF1	YGL090W	1266 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	CDC12	YHR107C	1224 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	RPS21B	YJL136C	264 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	YKL091C	YKL091C	933 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	COX19	YLL018C-A	297 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	IRC25	YLR021W	540 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	RPS0B	YLR048W	759 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	YLR049C	YLR049C	1287 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	RNA1	YMR235C	1224 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	RFA2	YNL312W	822 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	DSC2	YOL073C	969 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	YOR342C	YOR342C	960 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	RIB5	YBR256C	717 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	RRN7	YJL025W	1545 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	SSL1	YLR005W	1386 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	EMP70	YLR083C	2004 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	ROM1	YGR070W	3468 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	RTT103	YDR289C	1230 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	IES6	YEL044W	501 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	RPS8B	YER102W	603 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	CNN1	YFR046C	1086 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	TYS1	YGR185C	1185 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	MOH1	YBL049W	417 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	YNL013C	YNL013C	378 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	RPS8A	YBL072C	603 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	YPR108W-A	YPR108W-A	213 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	YBR137W	YBR137W	540 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	YBR300C	YBR300C	498 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	FLO1	YAR050W	4614 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	RGP1	YDR137W	1992 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	ISW2	YOR304W	3363 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	JEN1	YKL217W	1851 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	DET1	YDR051C	1005 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	EAF5	YEL018W	840 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	ARD1	YHR013C	717 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	BSD2	YBR290W	966 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	MIT1	YEL007W	2001 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	PRP31	YGR091W	1485 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	ARX1	YDR101C	1782 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	RPN6	YDL097C	1305 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	AUS1	YOR011W	4185 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	YMR317W	YMR317W	3423 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	PKH1	YDR490C	2301 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	TOP1	YOL006C	2310 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	ENT5	YDR153C	1236 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	DYN2	YDR424C	279 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	UBC6	YER100W	753 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	VMA22	YHR060W	546 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	GIS2	YNL255C	462 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	RPL19A	YBR084C-A	570 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	CCT7	YJL111W	1653 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	YSP2	YDR326C	4317 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	YAT2	YER024W	2772 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	NDT80	YHR124W	1884 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	PGS1	YCL004W	1566 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	YER085C	YER085C	522 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	CTR1	YPR124W	1221 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	KAP104	YBR017C	2757 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	YGL082W	YGL082W	1146 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	COQ9	YLR201C	783 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	RSA3	YLR221C	663 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	RUF21	RUF21	707 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	GGA1	YDR358W	1674 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	RPN5	YDL147W	1338 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	PTM1	YKL039W	1572 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	RAD2	YGR258C	3096 nt		2.65	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	ALG1	YBR110W	1350 nt		2.65	□□□□□ -1.98
VAR1	P02381	MAL12	YGR292W	1755 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	MAL32	YBR299W	1755 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	YDL071C	YDL071C	375 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	CWC2	YDL209C	1020 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	RPA14	YDR156W	414 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	YGR161W-C	YGR161W-C	279 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	RPS0A	YGR214W	759 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	GCD7	YLR291C	1146 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	ERG2	YMR202W	669 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	SSU72	YNL222W	621 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	YNR071C	YNR071C	1029 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	TIR2	YOR010C	756 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	NAT3	YPR131C	588 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	UTP25	YIL091C	2166 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	BDP1	YNL039W	1785 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	CHA4	YLR098C	1947 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	MRPL7	YDR237W	879 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	ENT3	YJR125C	1227 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	ERP1	YAR002C-A	660 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	BUD21	YOR078W	645 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	YBR053C	YBR053C	1077 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	TSC11	YER093C	4293 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	VPS53	YJL029C	2469 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	YGR291C	YGR291C	222 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	BCD1	YHR040W	1101 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	VTA1	YLR181C	993 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VAR1	P02381	ATG8	YBL078C	354 nt		2.63	□□□□□ -1.99

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