Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFT2D2O95562 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SFT2D2O95562 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SFT2D2O95562 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFT2D2O95562 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFT2D2O95562 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFT2D2O95562 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFT2D2O95562 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms