Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MATN4O95460 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MATN4O95460 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MATN4O95460 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MATN4O95460 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MATN4O95460 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MATN4O95460 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MATN4O95460 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MATN4O95460 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MATN4O95460 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MATN4O95460 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MATN4O95460 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MATN4O95460 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MATN4O95460 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MATN4O95460 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MATN4O95460 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MATN4O95460 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MATN4O95460 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MATN4O95460 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MATN4O95460 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MATN4O95460 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MATN4O95460 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MATN4O95460 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MATN4O95460 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MATN4O95460 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MATN4O95460 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MATN4O95460 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MATN4O95460 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MATN4O95460 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MATN4O95460 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MATN4O95460 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MATN4O95460 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MATN4O95460 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MATN4O95460 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MATN4O95460 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MATN4O95460 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MATN4O95460 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MATN4O95460 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MATN4O95460 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MATN4O95460 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MATN4O95460 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MATN4O95460 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MATN4O95460 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MATN4O95460 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MATN4O95460 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MATN4O95460 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MATN4O95460 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MATN4O95460 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MATN4O95460 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MATN4O95460 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MATN4O95460 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MATN4O95460 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MATN4O95460 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MATN4O95460 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MATN4O95460 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MATN4O95460 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MATN4O95460 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MATN4O95460 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MATN4O95460 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MATN4O95460 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MATN4O95460 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MATN4O95460 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MATN4O95460 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MATN4O95460 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MATN4O95460 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MATN4O95460 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MATN4O95460 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MATN4O95460 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MATN4O95460 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MATN4O95460 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MATN4O95460 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MATN4O95460 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MATN4O95460 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MATN4O95460 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MATN4O95460 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MATN4O95460 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MATN4O95460 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MATN4O95460 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MATN4O95460 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MATN4O95460 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MATN4O95460 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MATN4O95460 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MATN4O95460 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MATN4O95460 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MATN4O95460 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MATN4O95460 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MATN4O95460 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MATN4O95460 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MATN4O95460 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MATN4O95460 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MATN4O95460 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MATN4O95460 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MATN4O95460 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MATN4O95460 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MATN4O95460 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MATN4O95460 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MATN4O95460 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MATN4O95460 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MATN4O95460 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MATN4O95460 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms