Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG2O94898 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms