Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEBLO76041 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEBLO76041 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEBLO76041 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEBLO76041 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEBLO76041 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEBLO76041 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEBLO76041 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEBLO76041 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEBLO76041 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEBLO76041 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEBLO76041 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEBLO76041 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEBLO76041 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEBLO76041 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEBLO76041 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEBLO76041 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEBLO76041 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEBLO76041 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEBLO76041 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEBLO76041 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEBLO76041 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEBLO76041 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEBLO76041 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEBLO76041 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEBLO76041 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEBLO76041 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEBLO76041 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEBLO76041 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEBLO76041 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEBLO76041 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEBLO76041 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEBLO76041 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEBLO76041 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEBLO76041 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEBLO76041 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEBLO76041 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEBLO76041 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEBLO76041 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEBLO76041 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEBLO76041 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEBLO76041 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEBLO76041 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEBLO76041 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEBLO76041 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEBLO76041 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEBLO76041 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEBLO76041 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEBLO76041 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEBLO76041 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEBLO76041 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEBLO76041 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEBLO76041 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEBLO76041 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEBLO76041 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEBLO76041 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEBLO76041 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEBLO76041 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEBLO76041 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEBLO76041 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEBLO76041 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEBLO76041 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEBLO76041 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEBLO76041 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEBLO76041 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEBLO76041 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEBLO76041 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEBLO76041 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEBLO76041 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEBLO76041 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEBLO76041 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEBLO76041 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEBLO76041 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEBLO76041 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEBLO76041 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEBLO76041 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEBLO76041 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEBLO76041 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEBLO76041 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEBLO76041 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEBLO76041 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEBLO76041 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEBLO76041 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEBLO76041 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEBLO76041 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEBLO76041 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEBLO76041 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEBLO76041 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEBLO76041 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEBLO76041 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEBLO76041 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEBLO76041 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEBLO76041 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEBLO76041 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEBLO76041 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEBLO76041 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEBLO76041 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEBLO76041 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEBLO76041 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEBLO76041 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms