Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA4O75335 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA4O75335 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms