Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRP5O75197 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRP5O75197 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRP5O75197 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRP5O75197 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRP5O75197 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRP5O75197 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRP5O75197 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRP5O75197 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRP5O75197 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRP5O75197 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRP5O75197 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRP5O75197 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRP5O75197 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRP5O75197 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRP5O75197 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRP5O75197 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRP5O75197 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRP5O75197 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRP5O75197 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRP5O75197 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRP5O75197 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRP5O75197 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRP5O75197 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRP5O75197 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRP5O75197 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRP5O75197 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LRP5O75197 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRP5O75197 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRP5O75197 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRP5O75197 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRP5O75197 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRP5O75197 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRP5O75197 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRP5O75197 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRP5O75197 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRP5O75197 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRP5O75197 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRP5O75197 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRP5O75197 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRP5O75197 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRP5O75197 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRP5O75197 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRP5O75197 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRP5O75197 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRP5O75197 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRP5O75197 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRP5O75197 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRP5O75197 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LRP5O75197 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRP5O75197 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRP5O75197 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRP5O75197 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LRP5O75197 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRP5O75197 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRP5O75197 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRP5O75197 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRP5O75197 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRP5O75197 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRP5O75197 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRP5O75197 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRP5O75197 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LRP5O75197 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRP5O75197 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRP5O75197 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRP5O75197 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRP5O75197 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRP5O75197 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRP5O75197 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRP5O75197 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
LRP5O75197 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRP5O75197 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRP5O75197 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRP5O75197 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRP5O75197 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRP5O75197 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LRP5O75197 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRP5O75197 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRP5O75197 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LRP5O75197 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRP5O75197 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRP5O75197 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRP5O75197 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRP5O75197 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRP5O75197 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRP5O75197 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRP5O75197 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRP5O75197 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRP5O75197 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LRP5O75197 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRP5O75197 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRP5O75197 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRP5O75197 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRP5O75197 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRP5O75197 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRP5O75197 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRP5O75197 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRP5O75197 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRP5O75197 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LRP5O75197 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms