Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SIN3BO75182 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIN3BO75182 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms