Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSCO60682 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSCO60682 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSCO60682 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSCO60682 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSCO60682 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSCO60682 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSCO60682 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSCO60682 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSCO60682 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSCO60682 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSCO60682 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSCO60682 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSCO60682 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MSCO60682 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSCO60682 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MSCO60682 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSCO60682 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSCO60682 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSCO60682 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSCO60682 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSCO60682 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSCO60682 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSCO60682 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSCO60682 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MSCO60682 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MSCO60682 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MSCO60682 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MSCO60682 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSCO60682 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSCO60682 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSCO60682 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSCO60682 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSCO60682 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSCO60682 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MSCO60682 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSCO60682 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSCO60682 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSCO60682 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSCO60682 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSCO60682 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSCO60682 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSCO60682 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSCO60682 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSCO60682 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSCO60682 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSCO60682 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSCO60682 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSCO60682 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSCO60682 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSCO60682 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSCO60682 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSCO60682 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSCO60682 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSCO60682 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSCO60682 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSCO60682 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSCO60682 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSCO60682 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSCO60682 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MSCO60682 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSCO60682 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSCO60682 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSCO60682 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSCO60682 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSCO60682 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSCO60682 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSCO60682 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSCO60682 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSCO60682 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSCO60682 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MSCO60682 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSCO60682 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSCO60682 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSCO60682 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSCO60682 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSCO60682 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MSCO60682 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSCO60682 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSCO60682 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSCO60682 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSCO60682 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSCO60682 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSCO60682 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSCO60682 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSCO60682 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSCO60682 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSCO60682 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSCO60682 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSCO60682 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MSCO60682 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSCO60682 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MSCO60682 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
MSCO60682 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSCO60682 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSCO60682 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSCO60682 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSCO60682 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSCO60682 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSCO60682 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms