Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK4O60575 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK4O60575 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK4O60575 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK4O60575 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK4O60575 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK4O60575 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK4O60575 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK4O60575 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK4O60575 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK4O60575 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK4O60575 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPINK4O60575 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINK4O60575 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms