Protein–RNA interactions for Protein: O60565

GREM1, Gremlin-1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREM1O60565 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GREM1O60565 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GREM1O60565 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GREM1O60565 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GREM1O60565 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GREM1O60565 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GREM1O60565 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GREM1O60565 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GREM1O60565 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GREM1O60565 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GREM1O60565 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GREM1O60565 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GREM1O60565 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GREM1O60565 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GREM1O60565 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GREM1O60565 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GREM1O60565 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GREM1O60565 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GREM1O60565 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREM1O60565 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREM1O60565 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREM1O60565 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREM1O60565 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREM1O60565 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREM1O60565 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREM1O60565 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREM1O60565 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GREM1O60565 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREM1O60565 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GREM1O60565 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GREM1O60565 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GREM1O60565 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GREM1O60565 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GREM1O60565 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GREM1O60565 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GREM1O60565 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GREM1O60565 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GREM1O60565 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GREM1O60565 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GREM1O60565 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GREM1O60565 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GREM1O60565 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GREM1O60565 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GREM1O60565 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GREM1O60565 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GREM1O60565 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GREM1O60565 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GREM1O60565 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GREM1O60565 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GREM1O60565 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GREM1O60565 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GREM1O60565 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREM1O60565 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREM1O60565 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREM1O60565 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREM1O60565 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREM1O60565 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GREM1O60565 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREM1O60565 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREM1O60565 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREM1O60565 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREM1O60565 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GREM1O60565 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GREM1O60565 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREM1O60565 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GREM1O60565 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREM1O60565 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREM1O60565 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREM1O60565 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREM1O60565 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREM1O60565 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREM1O60565 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREM1O60565 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREM1O60565 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREM1O60565 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREM1O60565 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREM1O60565 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GREM1O60565 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREM1O60565 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREM1O60565 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREM1O60565 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREM1O60565 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREM1O60565 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREM1O60565 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREM1O60565 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREM1O60565 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREM1O60565 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREM1O60565 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREM1O60565 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GREM1O60565 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREM1O60565 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREM1O60565 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREM1O60565 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GREM1O60565 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GREM1O60565 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GREM1O60565 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GREM1O60565 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GREM1O60565 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GREM1O60565 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GREM1O60565 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms