Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL4O60488 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms