Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP8B3O60423 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8B3O60423 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms