Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
EXTL3O43909 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXTL3O43909 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms