Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP9O43818 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP9O43818 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP9O43818 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP9O43818 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP9O43818 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP9O43818 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP9O43818 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP9O43818 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP9O43818 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP9O43818 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRP9O43818 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRP9O43818 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRP9O43818 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRP9O43818 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRP9O43818 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRP9O43818 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP9O43818 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP9O43818 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP9O43818 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP9O43818 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP9O43818 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP9O43818 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP9O43818 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP9O43818 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP9O43818 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP9O43818 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP9O43818 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP9O43818 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP9O43818 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP9O43818 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP9O43818 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP9O43818 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP9O43818 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP9O43818 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP9O43818 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP9O43818 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP9O43818 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP9O43818 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP9O43818 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP9O43818 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP9O43818 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP9O43818 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP9O43818 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP9O43818 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP9O43818 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP9O43818 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP9O43818 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP9O43818 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP9O43818 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP9O43818 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP9O43818 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP9O43818 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP9O43818 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP9O43818 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP9O43818 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP9O43818 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP9O43818 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP9O43818 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP9O43818 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP9O43818 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP9O43818 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP9O43818 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP9O43818 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP9O43818 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP9O43818 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP9O43818 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP9O43818 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP9O43818 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP9O43818 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP9O43818 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP9O43818 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP9O43818 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP9O43818 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP9O43818 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP9O43818 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP9O43818 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP9O43818 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP9O43818 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP9O43818 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP9O43818 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP9O43818 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP9O43818 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP9O43818 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP9O43818 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP9O43818 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP9O43818 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP9O43818 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP9O43818 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP9O43818 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP9O43818 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP9O43818 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP9O43818 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP9O43818 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP9O43818 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP9O43818 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP9O43818 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP9O43818 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP9O43818 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP9O43818 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms