Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYNGR3O43761 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms