Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYNGR1O43759 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms