Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYTH3O43739 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms