Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HTATSF1O43719 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms