Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CITO14578 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CITO14578 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CITO14578 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CITO14578 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CITO14578 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CITO14578 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CITO14578 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CITO14578 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CITO14578 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CITO14578 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CITO14578 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CITO14578 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CITO14578 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CITO14578 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CITO14578 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CITO14578 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CITO14578 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CITO14578 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CITO14578 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CITO14578 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CITO14578 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CITO14578 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CITO14578 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CITO14578 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CITO14578 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CITO14578 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CITO14578 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CITO14578 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CITO14578 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CITO14578 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CITO14578 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CITO14578 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CITO14578 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CITO14578 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CITO14578 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CITO14578 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CITO14578 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CITO14578 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CITO14578 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CITO14578 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CITO14578 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CITO14578 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CITO14578 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CITO14578 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CITO14578 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CITO14578 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CITO14578 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CITO14578 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CITO14578 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CITO14578 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CITO14578 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CITO14578 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CITO14578 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CITO14578 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CITO14578 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CITO14578 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CITO14578 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CITO14578 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CITO14578 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CITO14578 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CITO14578 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CITO14578 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CITO14578 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CITO14578 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CITO14578 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CITO14578 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CITO14578 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CITO14578 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CITO14578 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CITO14578 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CITO14578 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CITO14578 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CITO14578 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CITO14578 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CITO14578 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CITO14578 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CITO14578 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CITO14578 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CITO14578 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CITO14578 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CITO14578 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CITO14578 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CITO14578 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CITO14578 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CITO14578 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CITO14578 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CITO14578 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CITO14578 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CITO14578 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CITO14578 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CITO14578 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CITO14578 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CITO14578 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CITO14578 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CITO14578 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CITO14578 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CITO14578 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CITO14578 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CITO14578 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms