Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PODXLO00592 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PODXLO00592 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PODXLO00592 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PODXLO00592 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PODXLO00592 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PODXLO00592 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PODXLO00592 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PODXLO00592 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PODXLO00592 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PODXLO00592 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PODXLO00592 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PODXLO00592 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PODXLO00592 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PODXLO00592 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PODXLO00592 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PODXLO00592 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PODXLO00592 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PODXLO00592 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PODXLO00592 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PODXLO00592 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PODXLO00592 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PODXLO00592 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PODXLO00592 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PODXLO00592 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PODXLO00592 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PODXLO00592 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PODXLO00592 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PODXLO00592 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PODXLO00592 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PODXLO00592 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PODXLO00592 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PODXLO00592 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PODXLO00592 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PODXLO00592 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PODXLO00592 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PODXLO00592 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PODXLO00592 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PODXLO00592 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PODXLO00592 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PODXLO00592 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PODXLO00592 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PODXLO00592 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PODXLO00592 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PODXLO00592 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PODXLO00592 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PODXLO00592 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PODXLO00592 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PODXLO00592 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PODXLO00592 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PODXLO00592 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PODXLO00592 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PODXLO00592 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PODXLO00592 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PODXLO00592 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PODXLO00592 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PODXLO00592 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PODXLO00592 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PODXLO00592 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PODXLO00592 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PODXLO00592 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PODXLO00592 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PODXLO00592 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PODXLO00592 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PODXLO00592 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PODXLO00592 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PODXLO00592 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PODXLO00592 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PODXLO00592 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PODXLO00592 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PODXLO00592 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PODXLO00592 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PODXLO00592 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PODXLO00592 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXLO00592 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXLO00592 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXLO00592 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXLO00592 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXLO00592 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms