Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS1O00470 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS1O00470 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms