Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
O00370 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
O00370 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
O00370 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
O00370 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
O00370 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
O00370 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
O00370 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
O00370 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
O00370 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
O00370 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
O00370 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
O00370 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
O00370 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
O00370 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
O00370 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
O00370 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
O00370 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
O00370 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
O00370 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
O00370 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
O00370 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
O00370 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
O00370 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
O00370 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
O00370 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
O00370 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
O00370 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
O00370 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
O00370 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
O00370 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
O00370 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
O00370 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
O00370 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
O00370 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
O00370 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
O00370 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
O00370 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
O00370 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
O00370 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
O00370 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
O00370 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
O00370 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
O00370 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
O00370 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
O00370 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
O00370 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
O00370 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
O00370 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
O00370 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
O00370 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
O00370 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
O00370 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
O00370 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
O00370 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
O00370 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
O00370 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
O00370 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
O00370 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
O00370 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
O00370 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
O00370 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
O00370 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
O00370 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
O00370 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
O00370 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
O00370 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
O00370 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
O00370 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
O00370 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
O00370 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
O00370 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
O00370 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
O00370 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
O00370 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
O00370 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
O00370 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
O00370 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
O00370 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
O00370 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
O00370 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
O00370 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
O00370 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
O00370 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
O00370 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
O00370 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
O00370 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
O00370 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
O00370 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
O00370 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
O00370 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
O00370 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
O00370 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
O00370 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
O00370 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
O00370 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
O00370 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
O00370 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
O00370 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
O00370 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms