Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNAP23O00161 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms