Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN8O00124 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN8O00124 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN8O00124 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN8O00124 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN8O00124 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN8O00124 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN8O00124 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN8O00124 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN8O00124 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN8O00124 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN8O00124 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN8O00124 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN8O00124 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN8O00124 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN8O00124 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBXN8O00124 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN8O00124 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN8O00124 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN8O00124 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN8O00124 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN8O00124 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN8O00124 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN8O00124 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN8O00124 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN8O00124 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN8O00124 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN8O00124 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN8O00124 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms