Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms