Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8VRH5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8VRH5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
F8VRH5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8VRH5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F8VRH5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
F8VRH5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8VRH5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8VRH5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8VRH5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8VRH5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8VRH5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8VRH5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8VRH5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8VRH5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8VRH5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8VRH5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8VRH5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8VRH5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8VRH5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8VRH5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8VRH5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8VRH5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8VRH5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8VRH5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F8VRH5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8VRH5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8VRH5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8VRH5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8VRH5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8VRH5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8VRH5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8VRH5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8VRH5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8VRH5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8VRH5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8VRH5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8VRH5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8VRH5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8VRH5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8VRH5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8VRH5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8VRH5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F8VRH5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8VRH5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8VRH5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8VRH5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
F8VRH5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8VRH5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8VRH5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8VRH5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8VRH5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8VRH5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8VRH5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8VRH5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8VRH5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8VRH5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
F8VRH5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F8VRH5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F8VRH5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
F8VRH5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F8VRH5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F8VRH5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F8VRH5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F8VRH5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F8VRH5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F8VRH5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms