Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HHLA1C9JL84 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HHLA1C9JL84 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HHLA1C9JL84 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HHLA1C9JL84 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HHLA1C9JL84 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HHLA1C9JL84 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HHLA1C9JL84 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HHLA1C9JL84 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HHLA1C9JL84 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HHLA1C9JL84 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HHLA1C9JL84 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HHLA1C9JL84 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HHLA1C9JL84 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HHLA1C9JL84 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HHLA1C9JL84 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HHLA1C9JL84 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HHLA1C9JL84 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HHLA1C9JL84 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms