Protein–RNA interactions for Protein: B3GLJ2

PATE3, Prostate and testis expressed protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATE3B3GLJ2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PATE3B3GLJ2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATE3B3GLJ2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms