Protein–RNA interactions for Protein: A8MYZ0

MINDY4B, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4B, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY4BA8MYZ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MINDY4BA8MYZ0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MINDY4BA8MYZ0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MINDY4BA8MYZ0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MINDY4BA8MYZ0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms