Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms