Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GOLGA6L4A6NEF3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6L4A6NEF3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms