Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP17L4A6NCW7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms