Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SSPOA2VEC9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms