Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC66A2RUB6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms