Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 VAMP7-201ENST00000262640 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 CCDC33-206ENST00000558821 1993 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 LDB3-203ENST00000372056 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 BTNL2-201ENST00000374993 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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MTHFRP42898 DTX3L-202ENST00000383661 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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MTHFRP42898 LINC01664-202ENST00000441544 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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MTHFRP42898 AC007923.4-201ENST00000578650 568 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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MTHFRP42898 AC011444.2-201ENST00000587759 567 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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MTHFRP42898 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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MTHFRP42898 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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MTHFRP42898 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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MTHFRP42898 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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MTHFRP42898 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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MTHFRP42898 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 MIR219A2-202ENST00000385220 97 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 DNM1P48-201ENST00000419538 439 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 C3orf18-202ENST00000422619 551 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 AL355298.1-201ENST00000425391 180 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 AC087163.1-201ENST00000430089 381 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 AL355309.1-201ENST00000442158 78 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 PLA2G6-213ENST00000447598 567 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 AC138956.2-201ENST00000512934 528 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 RRNAD1-211ENST00000524343 459 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 AP001775.1-201ENST00000532608 586 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 NKAPP1-203ENST00000554109 573 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 APOC1P1-202ENST00000571466 253 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 AC123595.2-201ENST00000607854 549 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 ADGRG5-207ENST00000615867 762 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 KATNAL2-202ENST00000356157 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MTHFRP42898 ZNRD1ASP-215ENST00000425604 1986 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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