Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 UIMC1-212ENST00000511320 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ZNF384-203ENST00000361959 2978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TSPYL6-201ENST00000317802 3089 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 JUP-201ENST00000310706 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 MKL1-213ENST00000620651 3757 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CCDC129-201ENST00000319386 4544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 EPB41L4A-201ENST00000261486 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 DPP4-201ENST00000360534 3904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PTGER4-201ENST00000302472 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PRICKLE1-215ENST00000640055 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SPIB-202ENST00000439922 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 LILRB1-201ENST00000324602 2774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ALDH8A1-201ENST00000265605 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 C1orf220-202ENST00000521244 2577 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ZNF274-201ENST00000326804 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CDKL1-201ENST00000216378 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CTSE-201ENST00000358184 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 NXPE1-205ENST00000536312 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ARHGEF9-213ENST00000624210 1888 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC073263.2-201ENST00000624835 1863 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 MIR100HG-223ENST00000636654 1434 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SLC44A2-202ENST00000407327 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ZNF558-201ENST00000301475 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 COG2-202ENST00000366669 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ASB15-201ENST00000275699 2706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 DCTN1-206ENST00000409868 4202 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SERPINA10-204ENST00000554723 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 KCND3-203ENST00000369697 7396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CAMK2G-207ENST00000423381 3824 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SKP2-202ENST00000274255 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CCDC33-206ENST00000558821 1993 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CARD8-215ENST00000520015 1931 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 MYT1-203ENST00000536311 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TROAP-215ENST00000551245 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 KIAA1683-206ENST00000600328 3819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ACSL6-204ENST00000379244 2658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SLC12A4-209ENST00000572037 3620 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 VPS26A-203ENST00000395098 2554 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC243772.2-201ENST00000428289 3543 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 NEK6-201ENST00000320246 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 RGS6-201ENST00000343854 5342 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CEP85-202ENST00000451429 4061 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 GPRASP2-205ENST00000543253 3935 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 UHRF1-207ENST00000624301 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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