Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A4Q9Y6R1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms