Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI1Q9Y6G9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms