Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX5Q9Y5X3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX5Q9Y5X3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX5Q9Y5X3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms