Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP16Q9Y5T5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms