Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q8

GTF3C5, General transcription factor 3C polypeptide 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5Q9Y5Q8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C5Q9Y5Q8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C5Q9Y5Q8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms