Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTDP1Q9Y5B0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDP1Q9Y5B0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDP1Q9Y5B0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDP1Q9Y5B0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDP1Q9Y5B0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDP1Q9Y5B0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDP1Q9Y5B0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTDP1Q9Y5B0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms